Impact de l\u27organisation des documents électroniques sur l\u27interprétation de l\u27information organique et consignée dans un contexte décentralisée

Intervention au colloque "Le numérique : impact sur le cycle de vie du document", organisé à l\u27université de Montréal par l\u27EBSI et l\u27ENSSIB du 13 au 15 octobre 2004. Dans un contexte de gestion documentaire décentralisée, l\u27organisation des documents électroniques est sous le contrôle direct des employés. Il est reconnu que ces derniers organisent ces documents électroniques selon des critères très personnels qui sont le plus souvent incompréhensibles pour les autres employés, rendant difficile le repérage et l\u27interprétation des documents. Cette communication se donne pour objet d\u27étudier plus avant le lien entre le mode d\u27organisation des documents électroniques et leur interprétation avant de conclure sur les besoins au niveau de la recherche et l\u27implication des résultats en matière de gestion du cycle de vie des documents

Schémas de classification et repérage des documents administratifs électroniques dans un contexte de gestion décentralisée des ressources informationnelles

Les employés d’un organisme utilisent souvent un schéma de classification personnel pour organiser les documents électroniques qui sont sous leur contrôle direct, ce qui suggère la difficulté pour d’autres employés de repérer ces documents et la perte possible de documentation pour l’organisme. Aucune étude empirique n’a été menée à ce jour afin de vérifier dans quelle mesure les schémas de classification personnels permettent, ou même facilitent, le repérage des documents électroniques par des tiers, dans le cadre d’un travail collaboratif par exemple, ou lorsqu’il s’agit de reconstituer un dossier. Le premier objectif de notre recherche était de décrire les caractéristiques de schémas de classification personnels utilisés pour organiser et classer des documents administratifs électroniques. Le deuxième objectif consistait à vérifier, dans un environnement contrôlé, les différences sur le plan de l’efficacité du repérage de documents électroniques qui sont fonction du schéma de classification utilisé. Nous voulions vérifier s’il était possible de repérer un document avec la même efficacité, quel que soit le schéma de classification utilisé pour ce faire. Une collecte de données en deux étapes fut réalisée pour atteindre ces objectifs. Nous avons d’abord identifié les caractéristiques structurelles, logiques et sémantiques de 21 schémas de classification utilisés par des employés de l’Université de Montréal pour organiser et classer les documents électroniques qui sont sous leur contrôle direct. Par la suite, nous avons comparé, à partir d'une expérimentation contrôlée, la capacité d’un groupe de 70 répondants à repérer des documents électroniques à l’aide de cinq schémas de classification ayant des caractéristiques structurelles, logiques et sémantiques variées. Trois variables ont été utilisées pour mesurer l’efficacité du repérage : la proportion de documents repérés, le temps moyen requis (en secondes) pour repérer les documents et la proportion de documents repérés dès le premier essai. Les résultats révèlent plusieurs caractéristiques structurelles, logiques et sémantiques communes à une majorité de schémas de classification personnels : macro-structure étendue, structure peu profonde, complexe et déséquilibrée, regroupement par thème, ordre alphabétique des classes, etc. Les résultats des tests d’analyse de la variance révèlent des différences significatives sur le plan de l’efficacité du repérage de documents électroniques qui sont fonction des caractéristiques structurelles, logiques et sémantiques du schéma de classification utilisé. Un schéma de classification caractérisé par une macro-structure peu étendue et une logique basée partiellement sur une division par classes d’activités augmente la probabilité de repérer plus rapidement les documents. Au plan sémantique, une dénomination explicite des classes (par exemple, par utilisation de définitions ou en évitant acronymes et abréviations) augmente la probabilité de succès au repérage. Enfin, un schéma de classification caractérisé par une macro-structure peu étendue, une logique basée partiellement sur une division par classes d’activités et une sémantique qui utilise peu d’abréviations augmente la probabilité de repérer les documents dès le premier essai.The employees of an organization often use a personal classification scheme to organize electronic documents residing on their own workstations. As this may make it hard for other employees to retrieve these documents, there is a risk for the organization of losing track of needed documentation. To this day, no empirical study has been conducted to verify whether personal classification schemes allow, or even facilitate the retrieval of documents created and classed by someone else, in collaborative work, for example, or when it becomes necessary to reconstruct a “dossier”. The first objective of our research was to describe the characteristics of personal classification schemes used to organize and classify administrative electronic documents. Our second objective was to verify, in a controlled environment, differences as to retrieval effectiveness which would be linked to the characteristics of classification schemes. More precisely, we wanted to verify if it was possible to find a document with the same effectiveness, whatever the classification scheme used. Two types of data collection were necessary to reach those objectives. We first identified the structural, logical and semantic characteristics of 21 classification schemes used by Université de Montréal employees to organize and classify electronic documents residing on their own workstations. We then compared, in a controlled experimentation, the capacity of 70 participants to find electronic documents with the help of five classification schemes exhibiting variations in their structural, logical and semantic characteristics. Three variables were used to measure retrieval effectiveness : the number of documents found, the average time needed (in seconds) to locate the documents and the number of documents found on the first try. Results revealed many structural, logical and semantic characteristics common to a majority of personal classification schemes : extended macro-structures, shallow, complex and unbalanced structures, thematic grouping, alphabetical order of classes, etc. An analysis of variance revealed significant differences as to retrieval effectiveness that are related to the structural, logical and semantic characteristics of the classification scheme. A classification scheme characterized by a narrow macro-structure and a logic based on classes of activities increases the probability of finding documents more rapidly. On the semantic level, more explicit denominations of classes (for example, by using definitions or avoiding acronyms and abbreviations) increases the probability of success in finding documents. Finally, a classification scheme characterized by a narrow macro-structure, a logic based on classes of activities, and a semantic that uses few abbreviations minimizes the risk of error and failure in retrieval

Cartographier l’évolution du contenu de la revue Archives au moyen des techniques de fouille de textes et de bibliométrie

À l’occasion du 50e anniversaire de l’Association des archivistes du Québec (AAQ), cinq professionnels de l’archivistique ont réalisé une analyse du contenu de la revue Archives à partir d’une approche basée sur des techniques de fouille de textes, complétée par une analyse bibliométrique. Ces techniques facilitent le traitement de grandes quantités de données afin d’en extraire automatiquement certaines caractéristiques qui les ont renseignés tant sur l’évolution thématique de la revue que sur la place qu’occupe sa production dans l’espace archivistique scientifique et professionnel québécois et international. Leur article offre une occasion de revenir sur les principales thématiques abordées dans la revue depuis les vingt dernières années en rendant compte de l’évolution des objets de recherche étudiés et, plus généralement, de la profession archivistique. Il permet également de s’interroger sur les liens existants entre les auteurs et leurs institutions, et de faire le point sur l’académisation ou la professionnalisation de la revue

Les pratiques pédagogiques exemplaires en sciences de l'information : 21 fiches annotées

Ce rapport constitue une version augmentée d’un premier rapport datant d’août 2005. Les 21 fiches annotées peuvent aussi être consultées individuellement (en format HTML) à partir du « Portail des ressources pédagogiques et disciplinaires en sciences de l'information » accessible à l’adresse : http://www.ebsi.umontreal.ca/clip/Ce rapport présente les résultats de projets d'intégration pédagogique réalisés dans le cadre du Comité local d'intégration pédagogique (CLIP) de l'École de bibliothéconomie et des sciences de l'information (EBSI) de l'Université de Montréal. Cet inventaire des pratiques pédagogiques exemplaires (best practices) en sciences de l'information (SI) fait partie du projet « Banque de ressources pédagogiques en sciences de l'information » ayant pour but la constitution d’un portail mettant à la disposition des enseignants en SI une variété de ressources pédagogiques actuellement dispersées et donc difficilement exploitables. La première partie de ce document présente un état de la question sur les pratiques pédagogiques exemplaires en SI, réalisé à partir des deux composantes suivantes : une revue de littérature sur les pratiques pédagogiques en SI, et une enquête menée auprès des enseignants de l’EBSI. La seconde partie du document est constituée de 21 fiches annotées sur les pratiques pédagogiques exemplaires en SI.Comité universitaire d'intégration pédagogique de l'Université de Montréal

The Elongator complex regulates hypocotyl growth in darkness and during photomorphogenesis

The Elongator complex (hereafter Elongator) promotes RNA polymerase II-mediated transcript elongation through epigenetic activities such as histone acetylation. Elongator regulates growth, development, immune response and sensitivity to drought and abscisic acid. We demonstrate that elo mutants exhibit defective hypocotyl elongation but have a normal apical hook in darkness and are hyposensitive to light during photomorphogenesis. These elo phenotypes are supported by transcriptome changes, including downregulation of circadian clock components, positive regulators of skoto-or photomorphogenesis, hormonal pathways and cell wall biogenesis-related factors. The downregulated genes LHY, HFR1 and HYH are selectively targeted by Elongator for histone H3K14 acetylation in darkness. The role of Elongator in early seedling development in darkness and light is supported by hypocotyl phenotypes of mutants defective in components of the gene network regulated by Elongator, and by double mutants between elo and mutants in light or darkness signaling components. A model is proposed in which Elongator represses the plant immune response and promotes hypocotyl elongation and photomorphogenesis via transcriptional control of positive photomorphogenesis regulators and a growth-regulatory network that converges on genes involved in cell wall biogenesis and hormone signaling. This article has an associated First Person interview with the first author of the paper

Hydroxyapatite nanoparticles-cell interaction: New approaches to disclose the fate of membrane-bound and internalised nanoparticles

Hydroxyapatite nanoparticles are popular tools in bone regeneration, but they have also been used for gene delivery and as anticancer drugs. Understanding their mechanism of action, particularly for the latter application, is crucial to predict their toxicity. To this end, we aimed to elucidate the importance of nanoparticle membrane interactions in the cytotoxicity of MG-63 cells using two different types of nanoparticles. In addition, conventional techniques for studying nanoparticle internalisation were evaluated and compared with newer and less exploited approaches. Hydroxyapatite and magnesium-doped hydroxyapatite nanoparticles were used as suspensions or compacted as specular discs. Comparison between cells seeded on the discs and those supplemented with the nanoparticles allowed direct interaction of the cell membrane with the material to be ruled out as the main mechanism of toxicity. In addition, standard techniques such as flow cytometry were inconclusive when used to assess nanoparticles toxicity. Interestingly, the use of intracellular calcium fluorescent probes revealed the presence of a high number of calcium-rich vesicles after nanoparticle supplementation in cell culture. These structures could not be detected by transmission electron microscopy due to their liquid content. However, by using cryo-soft X-ray imaging, which was used to visualise the cellular ultrastructure without further treatment other than vitrification and to quantify the linear absorption coefficient of each organelle, it was possible to identify them as multivesicular bodies, potentially acting as calcium stores. In the study, an advanced state of degradation of the hydroxyapatite and magnesium-doped hydroxyapatite nanoparticles within MG-63 cells was observed. Overall, we demonstrate that the combination of fluorescent calcium probes together with cryo-SXT is an excellent approach to investigate intracellular calcium, especially when found in its soluble form.Peer ReviewedPostprint (published version

Enzymatic synthesis of N-acetyllactosamine from lactose enabled by recombinant β1,4-galactosyltransferases

Utilising a fast and sensitive screening method based on imidazolium-tagged probes, we report unprecedented reversible activity of bacterial β1,4-galactosyltransferases to catalyse the transgalactosylation from lactose to N-acetylglucosamine to form N-acetyllactosamine in the presence of UDP. The process is demonstrated by the preparative scale synthesis of pNP-β-LacNAc from lactose using β1,4-galactosyltransferase NmLgtB-B as the only biocatalyst

Histone 2B monoubiquitination complex integrates transcript elongation with RNA processing at circadian clock and flowering regulators

Altres ajuts: CERCA Programme/Generalitat de CatalunyaHISTONE MONOUBIQUITINATION1 (HUB1) and its paralog HUB2 act in a conserved heterotetrameric complex in the chromatin-mediated transcriptional modulation of developmental programs, such as flowering time, dormancy, and the circadian clock. The KHD1 and SPEN3 proteins were identified as interactors of the HUB1 and HUB2 proteins with in vitro RNA-binding activity. Mutants in SPEN3 and KHD1 had reduced rosette and leaf areas. Strikingly, in spen3 mutants, the flowering time was slightly, but significantly, delayed, as opposed to the early flowering time in the hub1-4 mutant. The mutant phenotypes in biomass and flowering time suggested a deregulation of their respective regulatory genes CIRCADIAN CLOCK-ASSOCIATED1 (CCA1) and FLOWERING LOCUS C (FLC) that are known targets of the HUB1-mediated histone H2B monoubiquitination (H2Bub). Indeed, in the spen3-1 and hub1-4 mutants, the circadian clock period was shortened as observed by luciferase reporter assays, the levels of the CCA1α and CCA1β splice forms were altered, and the CCA1 expression and H2Bub levels were reduced. In the spen3-1 mutant, the delay in flowering time was correlated with an enhanced FLC expression, possibly due to an increased distal versus proximal ratio of its antisense COOLAIR transcript. Together with transcriptomic and double-mutant analyses, our data revealed that the HUB1 interaction with SPEN3 links H2Bub during transcript elongation with pre-mRNA processing at CCA1. Furthermore, the presence of an intact HUB1 at the FLC is required for SPEN3 function in the formation of the FLC-derived antisense COOLAIR transcripts

Numérique : impact sur le cycle de vie du document (Le)

Actes du colloque "Le numérique : impact sur le cycle de vie du document" organisé à l\u27université de Montréal par l\u27EBSI et l\u27ENSSIB du 13 au 15 octobre 2004. Son objectif était de traiter de façon interdisciplinaire la problématique suivante : « La numérisation, la diffusion des formats numériques originaux, les nouvelles méthodes d\u27indexation et d\u27analyse du document ainsi que le fonctionnement en réseau changent les données de base de la vie du document qui devient une sorte de phénix incessamment renaissant » (programme du colloque)

Antimicrobial resistance among migrants in Europe: a systematic review and meta-analysis

BACKGROUND: Rates of antimicrobial resistance (AMR) are rising globally and there is concern that increased migration is contributing to the burden of antibiotic resistance in Europe. However, the effect of migration on the burden of AMR in Europe has not yet been comprehensively examined. Therefore, we did a systematic review and meta-analysis to identify and synthesise data for AMR carriage or infection in migrants to Europe to examine differences in patterns of AMR across migrant groups and in different settings. METHODS: For this systematic review and meta-analysis, we searched MEDLINE, Embase, PubMed, and Scopus with no language restrictions from Jan 1, 2000, to Jan 18, 2017, for primary data from observational studies reporting antibacterial resistance in common bacterial pathogens among migrants to 21 European Union-15 and European Economic Area countries. To be eligible for inclusion, studies had to report data on carriage or infection with laboratory-confirmed antibiotic-resistant organisms in migrant populations. We extracted data from eligible studies and assessed quality using piloted, standardised forms. We did not examine drug resistance in tuberculosis and excluded articles solely reporting on this parameter. We also excluded articles in which migrant status was determined by ethnicity, country of birth of participants' parents, or was not defined, and articles in which data were not disaggregated by migrant status. Outcomes were carriage of or infection with antibiotic-resistant organisms. We used random-effects models to calculate the pooled prevalence of each outcome. The study protocol is registered with PROSPERO, number CRD42016043681. FINDINGS: We identified 2274 articles, of which 23 observational studies reporting on antibiotic resistance in 2319 migrants were included. The pooled prevalence of any AMR carriage or AMR infection in migrants was 25·4% (95% CI 19·1-31·8; I2 =98%), including meticillin-resistant Staphylococcus aureus (7·8%, 4·8-10·7; I2 =92%) and antibiotic-resistant Gram-negative bacteria (27·2%, 17·6-36·8; I2 =94%). The pooled prevalence of any AMR carriage or infection was higher in refugees and asylum seekers (33·0%, 18·3-47·6; I2 =98%) than in other migrant groups (6·6%, 1·8-11·3; I2 =92%). The pooled prevalence of antibiotic-resistant organisms was slightly higher in high-migrant community settings (33·1%, 11·1-55·1; I2 =96%) than in migrants in hospitals (24·3%, 16·1-32·6; I2 =98%). We did not find evidence of high rates of transmission of AMR from migrant to host populations. INTERPRETATION: Migrants are exposed to conditions favouring the emergence of drug resistance during transit and in host countries in Europe. Increased antibiotic resistance among refugees and asylum seekers and in high-migrant community settings (such as refugee camps and detention facilities) highlights the need for improved living conditions, access to health care, and initiatives to facilitate detection of and appropriate high-quality treatment for antibiotic-resistant infections during transit and in host countries. Protocols for the prevention and control of infection and for antibiotic surveillance need to be integrated in all aspects of health care, which should be accessible for all migrant groups, and should target determinants of AMR before, during, and after migration. FUNDING: UK National Institute for Health Research Imperial Biomedical Research Centre, Imperial College Healthcare Charity, the Wellcome Trust, and UK National Institute for Health Research Health Protection Research Unit in Healthcare-associated Infections and Antimictobial Resistance at Imperial College London